CTCLS、NGSのデータ解析に特化したソフトを発売、基盤構築も

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CTCLS、NGSのデータ解析に特化したソフトを発売、基盤構築も


掲載日:2014/04/24


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 CTCライフサイエンス株式会社(CTCLS)は、ゲノム配列解読装置の次世代シーケンサー(NGS)のデータ解析に特化した、米国Appistry Inc.のソフトウェア「GATK Genome Analysis Toolkit(GATK)」の販売から、同ソフトウェアを利用したワークフロー作成支援、日本語でのQ&Aサポート、ビッグデータに対応できるストレージや大規模コンピューティングなど、ユーザの状況に応じたIT基盤の構築までの提供を開始する。

 「GATK」は、米国のバイオメディカル研究機関Broad Institute of MIT and Harvardが開発し、無償配布されているNGSのデータ解析ソフトウェア。NGSで生成された大量データから遺伝子の変異解析を行なえ、腫瘍のサンプルを使用して、特定の癌の重要な体細胞変異を発見する癌研究の分野や、遺伝疾患の配列変異の可能性を探るバイオマーカーの発見/予測分野などで活用できる。

 約70のプログラムで構成され、複数のプログラムを組み合わせた解析フローを構築できる。NGSから得られたBAMファイル形式の1次データ品質の解析前チェック機能を備え、未チェックのデータ解析に比べ、より正確な結果を効率的に得られる。また、2つの遺伝子変異検出機能を組み合わせることで、解析結果の高精度化を図れる。


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